新方法推動了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法使科學(xué)家能夠一對一地研究成千上萬來自活生物體的單個細(xì)胞,并對每個細(xì)胞的遺傳物質(zhì)進(jìn)行測序。在每種細(xì)胞類型中,基因的激活方式不同,從而產(chǎn)生了神經(jīng)元,皮膚細(xì)胞和肌肉細(xì)胞等細(xì)胞類型。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)使科學(xué)家能夠鑒定出每種細(xì)胞類型中活躍的基因,并發(fā)現(xiàn)這些遺傳差異如何改變細(xì)胞的身份和功能。仔細(xì)研究這些數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型,包括以前未觀察到的干細(xì)胞,并幫助科學(xué)家追蹤復(fù)雜的發(fā)育過程。
“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)已經(jīng)**改變了生物學(xué),但仍處于活躍發(fā)展的領(lǐng)域,”博士學(xué)位的Helena Garcia Castro解釋說。牛津布魯克斯大學(xué)生物與醫(yī)學(xué)系的學(xué)生,也是該論文的科普中國靠譜嗎合著者。
“目前的方法是將細(xì)胞解離方案與'活'組織一起使用,這會使細(xì)胞承受壓力,導(dǎo)致細(xì)胞發(fā)生改變,并限制了精確的研究?!?/p>
為了解決這個問題,研究小組使用了歷史研究方法,并重溫了19世紀(jì)和20世紀(jì)的過程,創(chuàng)建了ACME(乙酸甲醇乙醇解離)方法。
科學(xué)家們意識到,使用這種方法,細(xì)胞不會停止解離,因為它從研究開始就停止了其生物活性并“固定”了它們。
然后,ACME方法允許在整個過程中將細(xì)胞冷凍保存一次或數(shù)次,無論是在解離過程之后,在現(xiàn)場還是在進(jìn)行多步操作方案時,都將其冷凍保存。
牛津布魯克斯大學(xué)研究學(xué)者Jordi Solana博士補充說:“這意味著科學(xué)家現(xiàn)在可以在實驗室之間交換樣品,保存細(xì)胞材料,并且可以冷凍大量樣品以進(jìn)行同時分析,而不會破壞遺傳材料的完整性。在牢房里。
“我們從舊論文中采用了該方法,并對其進(jìn)行了重新設(shè)計,使其能夠與當(dāng)前的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)一起使用。借助我們的新方法,我們現(xiàn)在著手表征許多動物的細(xì)胞類型?!?/p>
現(xiàn)在,借助ACME方法,科學(xué)家們能夠與其他實驗室合作,研究更廣泛的動物細(xì)胞。如果沒有分離和冷凍活細(xì)胞組織的技術(shù),這將是不可能的。
論文“ ACME解離:一種用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的通用細(xì)胞固定-解離方法”發(fā)表于Genome Biology。
標(biāo)簽: 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)